肛门肿痛的原因有可能是痔疮、肛裂、肛周脓肿等因素导致。
1、痔疮：腹腔当中的压力增高之后，就有可能会导致痔疮，也可能会引起内痔外痔和混合痔，造成肛门疼痛。可以通过手术切除来做治疗。
2、肛裂：肛裂是由于肛门周围的皮肤发生了损坏所导致的，也有可能会导致局部出现肿胀和疼痛。可以在医生指导下通过使用红霉素软膏、头孢克肟分散片和布洛芬缓释胶囊等药物治疗。
3、肛周脓肿：在出现肛周脓肿之后，有可能会引起局部有肿胀感和疼痛。可以通过切开引流的方法来做治疗。
除了以上原因，也不排除是肛门湿疹等因素所导致，还需要到医院做检查才能明确。