内眼皮长小水泡有可能是麦粒肿、过敏、疱疹病毒感染等因素所致。
1、麦粒肿：在受到金黄色葡萄球菌感染之后就有可能会导致麦粒肿，也可能会造成上眼睑皮肤出现肿胀和水泡。一般需要通过切开引流手术的方法来做治疗。
2、过敏：在接触到过敏原刺激之后，也有可能会导致病发生过敏，而且导致皮肤上面出现很多的小水泡和小丘疹，并伴有瘙痒症状。可以在医生指导下通过口服盐酸西替利嗪片、氯雷他定片、马来酸氯苯那敏片等药物治疗。
3、疱疹病毒感染：在受到疱疹病毒感染之后，有可能会在局部出现水泡的状态，并且会伴有发热和头晕头痛。可以在生指导下，通过口服阿昔洛韦片、伐昔洛韦片、利巴韦林片的药物治疗。
除了以上原因，也不排除是创伤等因素所导致的，还需要到医院做检查才能明确。