中度肠上皮化生的治疗方法包括饮食调理、药物治疗。如果发现异常，建议到医院就诊，再选择合适的治疗方案。
中度肠上皮化生是慢性萎缩性胃炎发生的一种病理性改变，可能是和平时的饮食不当有关，例如经常吃辛辣刺激性食物或经常吃腌制类食物，因此要调整饮食，避免吃辛辣刺激性的食物，并多吃蔬菜水果，有助于促进病情恢复。同时要配合医生服用药物治疗，一般是服用抑酸药物和促胃动力药物，例如奥美拉唑、莫沙必利等，如果存在胃黏膜损伤，需配合口服黏膜保护剂，例如枸橼酸铋钾、硫糖铝等。
另外，中度肠上皮化生在治疗期间应定期到医院复查，观察疾病的恢复情况。