包皮内侧起水泡根据原因针对性的治疗，有可能是摩擦、细菌感染、疱疹病毒感染等原因。
1、摩擦：可能是内裤不柔软的原因引起，容易导致包皮内侧部位受到刺激和引起摩擦，可能会引起水泡的症状。可以通过穿纯棉内裤和做好皮肤护理的方式缓解。
2、细菌感染：可能是局部的皮肤组织感染了葡萄，球菌等细菌引起容易导致皮肤出现红肿和引起水泡。可以在生指导下使用红霉素软膏、夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏等药物治疗。
3、疱疹病毒感染：感染疱疹病毒容易导致包皮局部出现起水泡，还可能会引起刺痛等多种的症状。也遵医嘱使用阿昔洛韦乳膏、喷昔洛韦乳膏、酞丁安乳膏等药物治疗。
除以上的原因以外，有可能是真菌感染等原因，需要做相关检查和治疗。