非典型磷状细胞瘤的治疗方法包括药物治疗、手术治疗以及放疗等。建议在医生的指导下，通过检查，进行治疗。
非典型鳞状细胞瘤可能是炎症刺激引起的，应在医生的指导下选择甲硝唑、四环素或者头孢他啶等多种抗炎药物治疗，可有效消除炎症，避免病情加重。非典型磷状细胞瘤出现癌变前兆时，应及时采取手术切除的方法治疗。
任由病情进展后，可能会诱发癌症，可采取高能射线进行放射治疗，有助于杀死癌细胞，同时不会对周围的正常组织造成影响。
治疗过程中应定期复查，并根据检查结果及时调整治疗措施。