囟门闭合早的危害是颅脑发育不良、小头畸形、智力低下等等。
1、颅脑发育不良：囟门过早的闭合属于不正常的现象，有可能会对颅脑发育造成不利的影响，从而会造成颅脑发育不良。
2、小头畸形：若是囟门过早闭合，并且存在站立不稳以及四肢僵硬的情况，有可能会形成小脑畸形。
3、智力低下：囟门闭合早也有可能会使脑组织发育受到影响，比较容易影响到智力，因此可能会引起智力低下。
除此之外，还有可能会出现惊厥发作的情况。