双侧基底节区多发性腔隙性脑梗塞可以通过药物治疗、其他方法治疗、手术治疗等方法，治疗期间应注意休息，避免过度劳累。
1、药物治疗：双侧基底节区多发性腔隙性脑梗塞可以在医生指导下使用天欣泰血栓心脉宁片、阿司匹林肠溶片、硫酸氢氯吡格雷片等药物治疗。
2、其他方法治疗：对于患者长时间用药物治，还要定期测量血压，才能使血压控制在正常范围，也需要严格控制饮食，坚持降糖治疗，可以改善患者病情。
3、手术治疗：对于病程时间较长患者，脑部记忆力减退严，针对这种情况需要结合脑部损伤情况开展手术方法治疗，还可以减轻头痛等情，术后需定期复诊检查，察觉是否有异常情况。
除上述治疗外，也可以通过抗血小板聚集治疗方法，治疗期间谨遵医嘱。