脚底起小水泡可能是鞋子摩擦、汗疱疹、真菌感染等原因导致的，可以到医院检查确定病因，对症治疗。
1、鞋子摩擦：如果患者长时间行走或者长时间站立，脚底部位的皮肤可能会受到鞋子的挤压，容易出现起小水泡的情况，一般不需要特殊治疗，能够自行吸收。
2、汗疱疹：如果平时不注意脚部的卫生，脚步发汗较多，有可能会引发汗疱疹导致局部极小水泡，可以在医生的指导下使用红霉素软膏、复方氟米松软膏、复方曲安奈德乳膏等药物治疗。
3、真菌感染：如果患者皮肤存在破损，有可能会引发真菌感染，导致脚底出现起水泡的情况，可以在医生的指导下使用盐酸特比萘芬乳膏、酮康唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏等药物治疗。
除了以上常见的原因外，还有可能是病毒感染导致的，患者可以到医院做进一步检查治疗。