核磁共振检查正确检查一般不会出现不良副作用，部分人群可能会出现耳部不适或者是心情紧张等。
核磁共振检查是一种比较常见的检查项目，是通过核磁成像检查出来的，大多数对人体没有损伤，安全性能比较高，多用于检查颅脑、腰椎病、颈椎病、腰椎等。通过检测结果，结合患者临床症状有助于病情诊断。
核磁共振检查可能会因为机器噪音比较大，容易对耳部造成损伤，出现耳朵不适症状，也可能是因为在幽闭的环境中，患者会产生恐惧心理导致心情过度紧张，如果经常性做检查，可能会容易引起心理疾病。