眼睑上长水疱可能是眼睑疱疹引起的，也有可能是湿疹和滤泡性结膜炎等原因引起的，建议患者在医生的指导下进行治疗。
1、眼睑疱疹：如果眼睑部位长有小水疱，有充血水肿的现象，一般是眼睑疱疹可使用抗病毒治疗。
2、湿疹：如果眼睑周围皮肤出现皮损，长有红斑和丘疹，还有丘疱疹伴有瘙痒的情况可能是湿疹，可遵医嘱使用他克莫司软膏和吡美莫司乳膏进行治疗。
3、滤泡性结膜炎：患者患有滤泡性结膜炎，会使患者眼睑部分长小水疱，在医生指导下使用。妥布霉素地塞米松滴眼液和氟米龙滴眼液进行治疗。
除此之外，如果患者患有眼睑炎，也可能出现眼睑部位长有小水疱的症状。