肝内胆管结石疼不疼不可以直接的判断，需要根据直径的大小决定。
肝内胆管结石，如果直径比较小的情况下，没有对肝内黏膜组织造成损伤，可能不伴有疼痛的症状。但是结石体积比较大的情况下，一般会导致肝脏组织摩擦，会伴有肝脏内血液循环不好，从而会伴有隐痛或者刺激性的疼痛症状。
肝内胆管结石通常需要配合医生做影像学检查，如果体积比较大的情况下，可以通过体外冲击波碎石治疗，对于恢复能够起到促进的作用，可以降低产生的影响。