真菌感染和细菌感染引起的原因不同、临床表现不同、治疗方法不同等。
1、引起原因不同：真菌感染主要是受到了真菌感染因素所导致，比较常见有霉菌、念珠菌等。细菌感染主要是受到了细菌感染因素所导致，比较常见的病原菌由金黄色葡萄球菌、链球菌等。
2、临床表现不同：细菌感染以后就有可能会导致皮肤的表面受到损伤，会诱发毛囊炎发生，而真菌感染以后就会导致手癣、足癣、脚癣等疾病发生。
3、治疗方法不同：细菌感染以后需要及时的在医生的指导下使用抗感染药物，比如红霉素软膏、莫匹罗星乳膏、夫西地酸乳膏等等。真菌感染以后，一般需要及时的在医生的指导下使用抗真菌药物，比如盐酸特比萘芬片、复方酮康唑片、克霉唑片等。