微波治疗滤泡性咽炎主要是通过微波热能对咽喉部位炎症滤泡烧灼和凝固，能起到消炎的作用。
微波属于是一种物理的方法，可以减少口服药物对胃肠道黏膜产生的刺激，可以直达病灶，帮助炎症消退，有利于临床症状的恢复。微波主要是对局部加热，可以促进局部的血液循环，增进代谢，帮助咽喉部位出现的炎症性感染消退，滤泡性咽炎一般是受到炎症反复刺激的因素所造成，需要把炎症消退之后，有利于临床症状的好转。
滤泡性咽炎在治疗的过程中也需要做好自身的饮食护理，选择清淡易消化食物，包括小米粥、软面条、南瓜粥等。