跑步后膝关节外侧疼可能是运动量比较大、血液循环不通畅、膝关节炎等原因导致，应该到正规的医院进行相关检查。
1、运动量比较大：平时跑步的时候，如果时间比较长，就可能会导致膝关节部位出现疼痛的症状，可以通过局部热敷的方法来帮助缓解。
2、血液循环不通畅：如果在寒冷的季节没有做好局部保暖工作的情况下，有可能会影响到血液循环，可以通过局部按摩和热敷的方法来帮助缓解。
3、膝关节炎：在跑步的时候可能会导致关节里面的炎性渗出物增多，就会出现局部疼痛的症状，在医生的指导下口服双氯芬酸钠缓释片、布洛芬缓释胶囊等药物来进行治疗。
除上述比较常见的病因以外，有可能是膝关节外侧组织损伤等原因导致，应该多卧床休息。