重度牙周炎治疗临床指南主要以消炎为主，医嘱及时服用，药物治疗，避免病情加重。
重度牙周炎大多是由于牙菌斑或者创伤性咬合引起，需要及时在医生指导下服用甲硝唑片、阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片等治疗，如果伴随有局部疼痛，还要配合布洛芬缓释胶囊或者对乙酰氨基酚片等改善疼痛。重度牙周炎，在治疗期间需要口腔当中炎症消除，然后拍牙片，根据不同的原因对症治疗。
重度牙周炎，如果是牙菌斑引起口腔炎症消失后，去医院通过超声波的高频率震荡，将牙结石去除达到治疗作用。