喉咙有水疱有可能是生理因素、咽炎、疱疹性咽峡炎等原因引起，还需要根据原因来调整治疗方法。
1、生理因素：吃比较烫的食物有可能会对咽喉黏膜造成刺激引起水疱，可以适当喝一些凉水缓解。
2、咽炎：在咽喉部位受到炎症感染时，也会出现咽喉有水疱，需要遵医嘱口服蒲地蓝消炎口服液、板蓝根颗粒、阿莫西林胶囊等。
3、疱疹性咽峡炎：在受到柯萨奇病毒感染之后有可能会出现疱疹性咽峡炎，需要在医生指导下服用阿奇霉素片、利巴韦林片、恩替卡韦片等药物治疗。
除此以外，也可能是带状疱疹感染，还需要在医生指导下调整治疗方法。