肛门的位置因为需要接触大便，如果没有注意清洁卫生，容易滋生病菌和感染。出现肝门瘙痒是常见的疾病症状，常见的疾病有痔疮、肛裂、肛周真菌感染等等。治疗这些疾病的时候还需要注意好保持洁净。
1.肛肠疾病所致：如肛裂、肛瘘、痔、直肠脱垂、肛门失禁等， 使肛门口分泌物增多，潮湿刺激皮肤引起瘙痒。
2. 肛周真菌感染：特别是在气候炎热潮湿的季节，体质肥胖多汗的老年容易发生皮肤真菌感染而引起股癣，往往因皮损扩大波及到肛门附近而引起肛周瘙痒。主要表现为大腿部内侧或臀部出现环形或半环形或地图样、边界清楚的红斑，表面多附有一层白色磷屑。当刮下其磷屑在显微镜下检查，可发现真菌菌丝和孢子。
3. 肛周病毒感染：患有肛门尖锐湿疣或传染性软疣时也可引起肛门瘙痒(瘙痒【译】：是许多皮肤病共有的一种自觉症状，如仅有皮肤瘙痒而无原发性皮肤损害时则称为瘙痒病。)。前者主要表现为肛门周围出现菜花样或似鸡冠花样的疣状增生物，潮湿污秽并有恶臭味;后者皮损形态表现为圆形或半球形的疣状增生物，中央有个“肚脐”样的凹陷，其发生的部位除了肛周、阴囊外，还可波及到全身皮肤。
4. 肛周寄生虫感染：一般见于儿童，但成人也会感染且夜间瘙痒最普遍。夜间肛门松弛时，蛲虫常从直肠内爬出，在肛门周围产卵交配，因刺激肛周皮肤引起肛门瘙痒，并以夜间瘙痒为特点。患疥疮时，如外阴部的皮肤损害蔓延到肛门附近也可引起肛门瘙痒。此外，患老年滴虫性阴道炎时因白带的刺激，也能引起肛门瘙痒。
5. 肛周湿疹：主要表现为肛周一圈出现丘疹、水疱，甚至糜烂渗液等皮肤损害，往往因剧烈瘙痒、反复搔抓而引起肛门周围皮肤增厚、苔藓化，外观大多变为灰白色。