阵发性睡眠性血红蛋白尿其实是一种罕见的疾病，而引起这种疾病的话，会造成患者出现贫血和血管内溶血的症状，严重的还可会继发肾官衰竭等这些并发症。
1、血栓形成
血栓事件是PNH患者的主要死因，动静脉均可发生。PNH患者血栓形成是多因素共同作用的结果，PNH患者补体活化及溶血过程中释放一些物质，如C5a，可使机体处于一种潜在的炎症状态下，炎症可使单核细胞、血管内皮细胞过度表达及释放组织因子，而启动凝血过程。炎症又可以和凝血系统相互作用，炎症因子加重凝血异常，凝血异常又可加剧炎症反应，形成恶性循环。炎症介质可破坏内皮细胞，内皮细胞活化增加，大量组织因子释放入血启动外源性凝血途径。
2、肺动脉高压
反复的血管内溶血使血液中游离的血红蛋白增加，血红蛋白与NO的结合能力要比氧气高百倍，NO的消耗增加；溶血或炎症损伤血管内皮细胞，内皮细胞合成的NO减少；溶血可释放精氨酸酶，合成NO的前体L-精氨酸分解增加，NO合成减少。最终将会导致NO的清除、生物利用度下降。正常机体NO量是PNH患者的6～10倍。而在机体内NO有重要的生理作用：调节平滑肌功能、平衡血管的舒缩活动、维持器官血流量。基于NO的生理功能，血液中NO含量下降，肺血管平滑肌功能失调、肺血管阻力增大逐渐形成PAH。
呼吸困难是PAH及右心室功能不全典型的临床表现。衡量PAH的2个重要指标：彩色多普勒和脑钠肽前体(amino terminal-pro brain natriuretic peptide，NT-proBNP)。BNP的水平与PAH及右心功能不全的程度相关联。
3、慢性肾脏疾病
慢性肾脏疾病也是多因素共同作用的结果，反复溶血，血红蛋白在肾近段小管重吸收，并在近端小管上皮细胞内分解为含铁血黄素，含铁血黄素沉积在肾小管上皮细胞内损伤肾小管；NO的消耗、生物利用度下降使肾脏血管收缩、阻力增大、肾血流量减少、肾脏缺血缺氧；肾脏内血栓形成等都会影响到肾脏功能造成急慢性肾损伤。临床表现：肾小管上皮细胞脱随尿液排出形成含铁血黄素尿，肾脏内血栓形成引发侧腰肋痛或腹痛、影像学上可表现为病肾增大，若双侧肾静脉主干血栓形成可致急性肾衰，表现为少尿、无尿、血肌酐、尿素氮进行性增高，肾小管功能异常还会出现肾性糖尿、蛋白尿，与溶血相关的严重高血压还可出现肾小球硬化等。
4、其它
常见的临床症状还有腹痛、吞咽困难、呼吸困难、勃起功能障碍、乏力等，正常的日常活动无法维持，严重影响患者的生活质量。究其原因都是由于溶血、NO消耗所引起。