衣原体是一种微生物病菌，对人体有侵蚀的危险，可以造成身体病毒感染，危及生命健康，因此，衣原体是人人谈之色变的东西，而生活中患上衣原体病毒的人不在少数，通常以检查衣原体阳性为感染指标，那么，衣原体阳性怎么治疗，要注意哪些问题呢？
衣原体对作用于细胞壁的药物耐药，如青霉素类、万古霉素、杆菌肽，对于抑制膜蛋白和胞浆蛋白合成药物敏感，如四环素、红霉素等。
治疗方案：首先四环素类，四环素500mg每日4次，连服7天，或用强力霉素100mg每日2次，连服7日。对四环素禁用或耐受性差的患者，可用含PHMB杀菌成分的液，每日2次，连续7日。
另外近年来新开发的对各领域的感染症广泛使用的新药喹诺酮类，在治疗衣原体方面临床效果较好，其中常用的药物有氧氟沙星（OFIX），环丙沙星（CPFX），洛美沙星，利福平治疗效果也较好。
治疗中应注意的问题：
（1）四环素类药物对妊娠妇女有致畸作用，故应禁用。
（2）从目前临床观察来看用喹诺酮类药物比应用四环素类药物为好，因为患者多数有淋球菌或其它合并感染。
（3）治疗时间2-3周为宜。衣原体繁殖周期为48-72小时，寄生在细胞内，药物渗入细胞内的浓度一般较低。所以治疗时间需要长些。
（4）在男女感染后无症状或症状轻微者，可视为带菌者，应接受正规治疗。对患者的性伴要同时治疗。
（5）联合用药：四环素类+洗液+喹诺酮类。