扁桃体疼痛，而且还有发炎的现象，在治疗上当然要科学的进行着治疗，就包括全身治疗，以局部治疗，全身的治疗就包括一些抗生素的使用，比如阿司匹林等这些解热镇痛剂。
1、全身治疗：本病多为链球菌感染，抗生素首选青霉素，青霉素过敏者可选用红霉素、林可霉素等。高热头痛及全身酸痛者可选用阿司匹林等解热镇痛剂。经2—3日治疗后如病情无好转，则应考虑是否病毒或其他细菌感染，改用抗病毒药、敏感抗生京或磺胺类药物，可酌情使用肾上腺皮质激素，如泼尼松、地塞米松等。
2、局部治疗：可选用
小儿患扁桃体炎时全身的感染症状很明显，孩子表现为：高烧可达39～40℃，同时伴有寒战，全身乏力，头痛及全身痛，食欲不振，恶心和呕吐。检查咽部时可发现扁桃体上有脓。这是最有力的诊断依据，因为光凭全身症状不能与其他感冒相区别。
3、急性扁桃体炎的治疗主要是控制感染，扁桃体炎多为细菌感染，特别是化脓性扁桃体炎更是化脓菌所致，所以必须使用抗生素。慢性扁桃体炎引起的扁桃体肥大可造成呼吸困难，特别是睡眠时，因舌头也松弛后倒，致使鼾声如雷，天长日久会因慢性缺氧而影响生长发育，慢性缺氧还会使孩子的智力发育受到影响。
4、扁桃体急性发炎时，采用青霉素类抗革兰氏阳性细菌抗生素或消炎药物，治疗效果很好。加上适当的休息，注意营养，一般在1周左右就可恢复正常。 如果炎症反复发作，则可转化成慢性。慢性扁桃体炎的症状不很明显，主要是咽痛。咽干、咽部不适、有口臭等表现。由于炎症的原因扁桃体常常比较肥大，但也有少数扁桃体萎缩而仍有慢性炎症者，并常合并伴有慢性咽炎。检查可见扁桃体表面充暗红色血、表面有瘢痕、及粘连、凹凸不平，腭舌弓亦可有慢性充血，有时颌下淋巴结也可肿大。慢性扁桃体炎也可用抗菌消炎药物，如反复急性发作，则需要施行手术切除，但一般5周岁以下儿童不适宜于手术治疗，多采用保守治疗，因其尚有一定的免疫作用。