熏艾条的最佳时间一般是半个小时左右。若在夏季天气比较炎热，温度较高，排汗量增加，身体的新陈代谢比较快。建议在半个小时以内。在穴位上熏艾草可以有效的预防疾病，起到缓解症状的作用。若在冬季天气较寒冷，新陈代谢比较慢。建议在30到40分钟之间。在日常生活中，也可以在室内进行熏艾。有效的进行室内消毒。
在一天中，建议早上或中午进行熏艾，此时阳气较旺盛，药物可以有效的进入体内。熏艾条也可以有效的缓解风湿性关节炎。