杆菌肽的作用与青霉素极其相似，一般对于肺炎双球菌，淋球菌，葡萄球菌，脑膜炎双球菌，革兰阳性细菌，阴性球菌和螺旋体都能起到很好的杀菌作用。由于会对原生质体产生一定的影响并且使得胞浆膜发生损害，让肾脏里面的毒性大量增加，因此一般不进行全身用药，多是在局部进行使用。主要是用于部分病人对青霉素耐药的皮肤感染以及葡萄球菌引起的感染等。