咖啡灌肠操作方法通常需要先把使用的灌肠袋清洗干净，还要配合使用专业的医疗器材，加上鼻胃管才可以做灌肠，在做咖啡灌肠的时候，要加入一定的温水，最好让水温接近于人体的正常温度，还要把灌肠的挂在高处。咖啡灌肠在操作的时候最好到医院让专业医生操作，避免在不正确的方法下会引起不良的状况，通过做咖啡灌肠，可以起到排宿便以及清理肠道的效果。
咖啡灌肠主要是利用了咖啡当中的棕酮酸，可以提高谷胱甘肽硫基转移酶的活性，也能清除血液当中的自由基，刺激体内的肠胃蠕动，同样可以把胃肠道以及肝脏部位的一些毒素排出来，是现在清理肠道比较常见到的方式，但是在做咖啡灌肠的时候不能私自操作，如果灌肠的方法不对，会对胃肠道产生刺激，也会影响到清理肠道的效果。刚做完咖啡灌肠要注意后期的饮食，不能马上吃辛辣刺激性食物，可以等到一个小时或者两个小时左右的时间，适量喝些半流质的汤类或者是粥，如果感觉有不适症状，比如腹部疼痛和恶心呕吐等，要及时和医生沟通。