补牙后牙根疼有可能是补牙前没有完全治疗好炎症或者是补牙过程中对牙龈造成很大刺激导致。补牙虽然是修复牙齿缺失的问题，但在补牙前一定要先做牙齿的CT拍片检查，一方面是看缺失的程度，另一方面是看牙髓是否有被损坏，不同的情况补牙的方式是不一样的，补牙后还要定期的复查，保持牙齿的清洁。
补牙后牙根疼的不同原因进行对症治疗：
1、补牙前的牙齿问题没有得到完整的治疗，如果在补牙后牙齿仍存在着疼痛的状况，很可能为坏死的牙髓没有清除干净，炎症继续停留在牙齿的根部，所以针对这样的情况，则需要进一步的二次治疗，将牙齿的问题彻底修复好后才能够进行补牙。
2、补牙过程中对牙龈出现刺激。在补牙的过程中也会有对牙齿的打磨以及使用灯烤来固定修复牙齿的材质。这些过程都会对牙龈和牙髓形成一定的刺激，牙齿会有相关敏感的症状表现出来，牙齿敏感的疼痛会几天后缓解，症状会自然消失。
3、牙齿的咬合度存在偏差：在补牙的最后一步会对牙齿进行打磨，修复牙齿的咬合程度。如果牙齿的咬合存在问题，凹凸不平并没有和本身的咬合部位形成比较好契合，则容易对牙龈和牙周形成较大的压力，造成牙齿疼痛，找专业的牙科医生进行调整即可，疼痛感会随之消失。