褪黑素副作用可能会对胃肠道造成一定的刺激，会引起胃肠功能紊乱的症状。
褪黑素如果长时间服用之后，就有可能会对胃肠道造成刺激，容易引起胃肠功能紊乱的症状，通常会表现为恶心呕吐和腹部胀痛，也可能会出现食欲不振和消化不良。在出现这些问题之后，要及时停止服用药物，大部分的人群在停止服用药物之后，症状可以得到改善。
褪黑素属于一种激素类的药物，可以达到清除自由基以及抑制脂质过氧反应的效果，也可以改善黑色素沉着的症状，但是没有办法彻底的清除黑色素。对于黑色素沉着的问题，比较严重的人群可以通过光子嫩肤的方法来做改善，能够达到快速美白肌肤的效果，也能使皮肤变得更加的白皙和光滑，也可以通过激光的方法来达到淡化黑色素的作用。