输尿管囊肿一般情况下不严重，但也要根据自身情况来判断，如果囊肿比较大可能也会比较严重。
输尿管囊肿位于输尿管部位的增生性病变，可能是先天发育不良、后天炎症刺激引起的局部增生，属于良性病变，生长速度也比较慢，比较小的囊肿不会对输尿管和身体健康产生太大影响，也不会有临床不适，囊肿性病变通常不会引起恶化，较小囊肿可以先进行观察，定期复查。
输尿管当中比较大，可能会对输尿管和膀胱壁形成压迫，导致输尿管狭窄，从而造成排尿功能障碍，较大囊肿也有一定的严重程度，需要进行外科手术、内镜手术等方法进行切除。