小柴胡如果用药不当的情况下，可能会产生副作用，会造成胃肠道，不是肝损伤等副作用，建议在医生的指导下明确病因，对症用药。
小柴胡属于中成药，在医生的指导下合理用药，一般情况下是不会引起副作用的。小柴胡具有解热、利胆的功效，可以用来治疗邪犯少阳证引起的食欲不振，口干咽干等症状。
另外患者风寒感冒过敏体质不建议使用此药物，而且在服用药物期间，要密切观察身体变化，如果出现副作用的情况，应马上停止药物就医治疗。