使用莫匹罗星软膏应注意饮食清淡、不要吃辛辣刺激的食物、注意皮肤表面卫生，建议在医生的指导下使用药物。
在使用莫匹罗星软膏时，皮肤出现破损不建议使用，因为莫匹罗星软膏中含有聚乙二醇有潜在肾毒性，如果皮肤出现破损涂抹可能会造成肾脏损伤加重。如果对莫匹罗星有过敏的情况下不建议使用，可能会使皮肤表面出现瘙痒，刺痛、呼吸困难等症状。
另外哺乳期、孕妇、儿童应该慎用，以免对身体产生影响。在服用药物期间要注意饮食清淡，不要吃辛辣刺激的食物，多喝水，积极配合医生治疗。