内生软骨瘤发病的原因通常情况下可能是遗传因素、软骨发育异常、长期慢性炎症等原因导致的。
1、遗传因素：内生软骨瘤可能是由于遗传因素导致的，所以在孕前怀孕期间都应当做好产检，了解胎儿的健康状态。
2、软骨发育异常：内生软骨瘤是由于软骨发育异常导致的，属于良性的肿瘤，如果体积比较小，没有明显不适的症状，可以暂时观察，不做特殊治疗。
3、长期慢性炎症：如果患有骨骼长期炎症容易炎症，长期的刺激可能会导致内生软骨瘤，如果体积比较大并伴有明显不适的症状，可以在医生指导下通过刮除术、刮除植骨术等手术方式治疗。
除以上常见原因外，也有可能是所处的环境、长期辐射等原因导致的，需要根据原因治疗。