睡醒右边头疼一阵一阵的疼，多考虑是睡眠不足、环境因素、姿势不当等原因引起的，也可能是颈椎病、植物神经紊乱等疾病导致的，建议患者到医院进行检查，根据具体病因，遵医嘱进行合理治疗。
1、睡眠不足：长时间熬夜或者作息时间紊乱，通常会导致身体过度疲劳，睡醒后出现头部阵痛、困倦等症状。建议患者养成良好的作息习惯，尽量做到早睡早起，保证充足的睡眠时间。
2、环境因素：睡眠环境温度过低并且不注意自身保暖，寒气通常会对头部造成刺激，可能引起一侧头部疼痛、手脚发凉等症状。建议转移到温暖舒适的居住环境当中，也可以适当增加衣物帮助保暖，避免身体持续受到寒冷刺激。
3、姿势不当：如果睡觉姿势不当，长时间保持同一姿势，一般会导致局部血液循环受阻，可能引发头部剧烈疼痛、局部痉挛等症状。建议养成良好的睡觉姿势，可以适当更换姿势，帮助促进身体血液循环。
4、颈椎病：一般是颈椎部位退行性病变引起的疾病，此时可能会影响颈椎功能，累及到周围肌肉和神经系统，睡醒后出现局部放射性疼痛、肌肉僵硬等症状。患者可以适当对局部进行按揉，通过顺时针和逆时针打圈按揉的方式，能够使局部肌肉得到放松。
5、植物神经紊乱：一般是精神受到异常刺激或长时间生气引起的疾病，如果患有该疾病，患者神经系统可能会出现异常，引起上述症状。还可能伴随心慌、胸闷气短等症状。建议遵医嘱服用甲钴胺片、维生素B12片等药物治疗，可以帮助营养神经系统，有利于控制病情。
在日常生活当中，建议患者多观察自身症状，积极配合医生治疗，避免延误病情对身体健康造成影响。