同房的时候小肚子疼可能是生理性、心理性或病理性等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.生理性因素：同房时由于生殖器官充血，可能会引起轻微的腹部不适。这种情况通常无需特殊处理，休息后可自行缓解。
2.心理性因素：紧张、焦虑等情绪因素也可能导致同房时出现腹痛。建议放松心情，必要时可咨询心理医生进行心理疏导。
3.病理性因素：盆腔炎、子宫内膜异位症等妇科疾病也可能引起同房时腹痛。这类情况需要及时就医，明确诊断后进行相应治疗。如盆腔炎可使用抗生素治疗，如头孢克肟、甲硝唑等；子宫内膜异位症可使用激素类药物，如炔诺酮、孕激素等，但需在医生指导下用药。
除以上原因外，还可能与性生活姿势不当、性生活过于频繁等因素有关。建议注意性生活卫生，避免过于剧烈的动作，如有不适及时就医。