小孩肛门疼可能是便秘、肛裂或痔疮等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.便秘如果小孩长时间不排便，粪便在肠道内滞留过久，可能会导致便秘，进而引起肛门疼痛。治疗便秘可以采用增加膳食纤维的摄入、多喝水以及适当运动等方法，必要时可在医生指导下使用开塞露、乳果糖口服溶液或聚乙二醇等药物。
2.肛裂肛裂是指肛门黏膜出现裂伤，常见于便秘或腹泻的小孩。治疗肛裂需要保持大便通畅，避免用力排便，同时可在医生指导下使用痔疮膏、复方角菜酸酯栓等药物缓解症状。
3.痔疮痔疮是指肛门周围静脉丛异常扩张，可能因久坐、便秘、腹压增高等因素引起。治疗痔疮需要改善生活习惯，增加运动，保持大便通畅，必要时可在医生指导下使用马应龙麝香痔疮膏、地奥司明片或复方血栓通胶囊等药物。
除以上原因外，还可能与过敏、感染等因素有关。建议家长注意小孩的饮食卫生，避免过敏原，如出现持续疼痛或症状加重，应及时就医。