菖蒲和远志可以一起使用，但需在医生指导下进行。这两种中药材在中医中都有各自的药用价值，合理搭配可以发挥更好的治疗效果。
菖蒲具有开窍醒神、化痰止咳的功效，常用于治疗痰湿蒙蔽清窍、神志不清等症状。远志则具有安神益智、祛痰开窍的作用，适用于心神不宁、失眠多梦等症状。在临床应用中，菖蒲和远志常与其他药物配伍使用，如石菖蒲配伍远志、酸枣仁、龙骨等，可以增强安神开窍的效果；远志配伍菖蒲、郁金、白术等，可以改善痰湿内阻、神志不清的症状。但需要注意的是，菖蒲和远志都有一定的毒性，过量使用可能会导致中毒反应，因此必须在医生指导下合理用药。
在使用菖蒲和远志时，还应注意药物的剂量和用药时间。一般建议从小剂量开始，逐渐增加至适宜剂量，并在医生指导下调整用药方案。同时，要密切关注患者的身体反应，如出现不适症状，应立即停药并及时就医。此外，菖蒲和远志不宜与某些药物同用，如含有重金属离子的药物，可能会增加毒性反应的风险。
总之，在医生指导下合理使用菖蒲和远志，可以发挥其药用价值，改善相关症状。但应注意药物剂量和用药时间，避免过量使用或与其他药物产生不良反应。