脑干血栓通常可以治疗，但治疗效果和预后因个体差异而异。治疗的目的是恢复脑部血流，减少脑组织损伤，并预防并发症。
脑干血栓的治疗通常包括药物治疗和康复治疗。药物治疗可能包括抗血小板药物如阿司匹林、硫酸氢氯吡格雷，以及抗凝药物如华法林、达比加群。此外，溶栓治疗如阿替普酶在发病初期可能被考虑使用，但需在医生严格评估后决定。所有这些药物都应在医生指导下使用，以避免不良反应和药物相互作用。
对于脑干血栓患者，及时就医和接受专业治疗至关重要。同时，患者应遵循医嘱，定期复查，积极参与康复训练，以提高生活质量和恢复功能。