沙眼衣原体感染通常不会自愈。沙眼衣原体是一种细菌，能够引起多种眼部疾病，包括沙眼和结膜炎等。如果不进行治疗，感染可能会持续存在，甚至导致视力损害。
沙眼衣原体感染的治疗通常需要使用抗生素。常见的治疗药物包括阿奇霉素、多西环素和四环素等。这些药物可以有效抑制沙眼衣原体的生长，减轻症状，并防止感染的进一步扩散。然而，使用这些药物时必须在医生的指导下进行，因为不当使用抗生素可能导致耐药性的发展，或者引起其他不良反应。
对于沙眼衣原体感染，及时就医并遵循医嘱进行治疗是非常重要的。同时，保持良好的个人卫生习惯，如勤洗手、不共用毛巾等，也有助于预防感染的发生和传播。