通常，早上喝牛奶肚子疼可能是乳糖不耐受、牛奶过敏或消化系统疾病等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.乳糖不耐受：部分人群由于体内缺乏乳糖酶，无法分解牛奶中的乳糖，导致消化不良，出现肚子疼等症状。治疗方法包括避免摄入乳糖或使用乳糖酶替代品，如乳糖酶片、乳糖酶口服液等。
2.牛奶过敏：牛奶过敏是由于免疫系统对牛奶中的蛋白质产生过敏反应，可能引起腹痛、腹泻等症状。治疗方法包括避免接触牛奶或使用抗过敏药物，如非那根、氯雷他定、盐酸西替利嗪等。
3.消化系统疾病：某些消化系统疾病，如胃溃疡、胃炎等，也可能导致喝牛奶后出现肚子疼。治疗方法需要针对具体疾病，如使用抗酸药物、抗菌药物等。
除以上原因外，还可能与个人体质、饮食习惯等因素有关。建议在医生指导下调整饮食结构，避免过敏原，并定期进行体格检查。