指甲盖凹凸不平可能是由于轻微的外伤、营养不良或真菌感染等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.轻微外伤：日常生活中不小心的碰撞或挤压可能导致指甲受损，出现凹凸不平的现象。这种情况下，一般不需要特别治疗，随着指甲的生长，受损部分会逐渐被剪掉。
2.营养不良：缺乏某些微量元素如锌、铁等，可能导致指甲生长异常。可以通过补充含有这些元素的食物，如瘦肉、豆类、坚果等，必要时在医生指导下使用硫酸锌、硫酸亚铁等药物。
3.真菌感染：长期潮湿环境或个人卫生习惯不良，可能导致指甲真菌感染，出现凹凸不平、变厚等症状。这种情况需要及时就医，在医生指导下使用抗真菌药物如酮康唑、特比萘芬、伊曲康唑等进行治疗。
除以上原因外，还可能与遗传因素、某些系统性疾病等因素有关。平时注意保持手部清洁干燥，避免长时间浸泡在水中，定期修剪指甲，发现异常及时就医。