洋葱发芽后，一般可以食用，但口感和营养价值会有所降低。发芽的洋葱中，水分减少，质地变软，辛辣味减弱，同时发芽过程中可能会产生一些不利于健康的物质。
发芽洋葱中可能含有的有害物质包括硫化物和丙烯酰胺等，这些物质在发芽过程中可能会增加。因此，食用发芽洋葱时，应优先选择没有明显霉变、腐烂的洋葱，并在医生指导下或遵医嘱用药，如出现不适症状，应及时就医。常见的洋葱处理方法包括将发芽部分切除后食用，或者使用洋葱提取物、洋葱粉等替代品。
对于发芽洋葱的食用，建议在确保洋葱没有霉变和腐烂的情况下，适量食用，并注意观察身体反应。如果对洋葱的安全性有疑虑，可以选择新鲜的洋葱或其它蔬菜替代。