肚脐眼正中间一按就疼可能是由于皮肤感染、脐疝或者内脏器官疾病等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1. 皮肤感染肚脐周围皮肤破损后，细菌入侵可能导致局部感染，表现为红肿、疼痛。治疗时可使用抗生素软膏如红霉素软膏、氯霉素软膏等外用，必要时口服头孢克洛、阿莫西林等抗生素，需遵医嘱用药。
2. 脐疝腹膜或腹腔内器官通过脐环突出形成脐疝，按压时可有疼痛感。轻度脐疝可保守治疗，如使用疝带压迫；严重时需手术修补，常用手术方式有开放修补术和腹腔镜修补术。
3. 内脏器官疾病如阑尾炎、肠梗阻等腹腔内疾病，炎症刺激腹膜可导致脐周疼痛。治疗需针对原发病，如阑尾炎可使用头孢曲松、甲硝唑等抗生素，必要时需手术切除阑尾。
除以上原因外，还可能与腹壁肌肉拉伤等因素有关。平时注意脐部清洁，避免用力抠挖。如疼痛持续不缓解，应及时就医明确诊断，以免延误病情。