牙根部发黑可能是牙菌斑积累、牙釉质损伤或牙髓病变等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1. 牙菌斑积累日常饮食中食物残渣和细菌在牙齿表面形成牙菌斑，长期积累可能导致牙根部发黑。可以通过定期洗牙和使用含氟牙膏刷牙来预防和改善。
2. 牙釉质损伤长期饮用含氟量过高的水或频繁摄入酸性食物饮料，可能导致牙釉质损伤，使牙根部发黑。治疗时可使用氟化钠溶液、磷酸钙和氟化亚锡等药物，应在医生指导下用药。
3. 牙髓病变牙髓感染或炎症引起的牙髓病变，可能导致牙根部发黑。治疗时可使用甲硝唑、阿莫西林和头孢克肟等抗生素，需遵医嘱用药。
除以上原因外，还可能与口腔卫生不良等因素有关。日常应保持良好的口腔卫生习惯，定期检查牙齿，发现问题及时就医。