牙齿牙根发黑可能是牙菌斑、牙结石或者牙髓坏死等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.牙菌斑：牙菌斑是牙齿表面形成的一层细菌膜，如果不及时清除，会导致牙齿表面变色，牙根发黑。定期使用含氟牙膏刷牙，并使用牙线清理牙缝，可以有效预防牙菌斑的形成。
2.牙结石：牙结石是由牙菌斑矿化形成的硬质沉积物，通常附着在牙齿表面，尤其是牙根附近。牙结石不仅会导致牙齿变色，还可能引发牙龈炎等口腔疾病。牙结石需要通过专业的洗牙来清除。
3.牙髓坏死：牙髓坏死是由于牙齿内部的牙髓组织受到感染或损伤导致的，牙髓坏死后牙齿失去营养供应，牙齿结构会逐渐变脆，颜色也会变暗。牙髓坏死的治疗通常需要进行根管治疗。
除以上原因外，还可能与遗传因素、药物副作用等因素有关。平时应注意口腔卫生，定期进行口腔检查，一旦发现牙齿变色应及时就医。