阴茎根部上面长痘痘可能是毛囊炎、皮脂腺囊肿或性传播疾病等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.毛囊炎
由于局部皮肤毛囊受到细菌感染，如金黄色葡萄球菌等，导致毛囊发炎，形成痘痘。治疗方法包括局部清洁、使用抗生素软膏如红霉素软膏、氯霉素软膏等，必要时口服抗生素如阿莫西林、头孢类抗生素等。
2.皮脂腺囊肿
皮脂腺管堵塞，皮脂分泌物积聚形成囊肿。治疗方法主要是手术切除囊肿，术后使用抗生素预防感染，如头孢克肟、左氧氟沙星等。
3.性传播疾病
如梅毒、生殖器疱疹等性传播疾病，可引起阴茎根部长痘痘。治疗方法主要是使用抗病毒药物如阿昔洛韦、伐昔洛韦等，必要时还需使用抗生素预防继发细菌感染。
除以上原因外，还可能与局部皮肤摩擦、过敏等因素有关。平时注意局部清洁卫生，避免过度清洗导致皮肤干燥。如症状持续不缓解，应及时就医，明确诊断，遵医嘱用药。