大蒜发芽后一般可以食用，但口感和营养价值可能有所下降。若大蒜发芽的同时出现发霉、腐烂等情况，则不能继续食用，以免引发身体不适。
大蒜发芽属于正常的生理现象，并不会产生有毒物质。发芽过程中，蒜瓣中的部分营养物质会被消耗，导致蒜瓣逐渐干瘪，口感变差，但此时大蒜仍可食用。若储存环境湿度过高，可能导致大蒜霉变，表面出现黑色或绿色霉斑，此时大蒜可能产生黄曲霉毒素等有害物质，继续食用可能危害健康。
日常储存大蒜时，建议将其放置在阴凉、通风、干燥的环境中，避免潮湿。如果发现大蒜已经发芽但未霉变，可以尽快食用。若发现大蒜发霉或腐烂，应及时丢弃，避免误食。