五班三倒作为一种频繁轮换昼夜班次的工作制度，可能对身体健康产生较大影响，尤其是长期持续的情况下。这种作息不规律的状态可能干扰人体生物钟，引发多方面的健康问题。
五班三倒容易导致睡眠障碍，频繁切换班次会打乱正常的昼夜节律，造成入睡困难、睡眠质量下降或睡眠时间不足。长期睡眠紊乱可能影响记忆力和免疫力，增加疲劳感。昼夜节律紊乱还会影响褪黑素分泌，干扰内分泌系统正常功能，可能引起激素水平波动，部分人群可能出现月经失调或代谢异常。此外，不规律的工作时间可能造成饮食不规律，增加胃肠负担，出现消化不良、胃痛等症状，长期可能诱发慢性胃炎等疾病。
对于心血管系统而言，研究表明轮班工作者发生高血压、冠状动脉粥样硬化性心脏病的风险较常规作息人群增高约20-30%，可能与持续应激状态和自主神经功能失调有关。从心理健康角度看，长期昼夜颠倒的工作模式可能引发焦虑、抑郁情绪，社交时间减少也可能加重心理压力。
为减轻影响，建议在非工作时间尽量保持规律作息，创造黑暗安静的睡眠环境，必要时可遵医嘱短期使用助眠药物。饮食方面注意定时定量，避免高脂夜宵。每半年至一年进行健康体格检查，重点关注血压、血糖、血脂等指标。若出现持续头痛、胸痛等异常症状，应及时就医排查器质性疾病。