婴儿腹泻通常可以使用益生菌进行辅助治疗，但具体效果因病因不同可能存在差异，建议在医生指导下合理使用。
婴儿腹泻的病因较多，常见如病毒或细菌感染、乳糖不耐受、饮食不当等。部分益生菌菌株如鼠李糖乳杆菌GG、布拉氏酵母菌等，可通过调节肠道菌群平衡、抑制致病菌增殖来缓解病毒性腹泻。但若为细菌性肠炎，需遵医嘱使用头孢克肟颗粒等抗生素治疗，此时益生菌可能无法单独起效。此外，乳糖不耐受引起的腹泻需改用无乳糖配方奶粉，益生菌对此类腹泻的改善作用有限。
需注意早产儿、免疫功能异常患儿使用益生菌存在一定风险，可能引发菌血症等并发症。家长应选择国家批准适用于婴幼儿的益生菌制剂，避免盲目使用成人剂型。若腹泻伴有高热、血便或持续超过3天未缓解，应立即就医进行大便常规、轮状病毒检测等检查，明确病因后规范治疗。
治疗期间需注意维持水电解质平衡，可遵医嘱口服补液盐Ⅲ预防脱水。喂养时应保持餐具清洁，母乳喂养者母亲需避免进食生冷刺激食物。益生菌的服用时间需与抗生素间隔2小时以上，避免影响疗效。