龙葵根茎含有一定毒性，通常不建议直接食用或药用。其毒性主要来源于所含的龙葵碱等生物碱成分，若处理不当可能引发中毒反应，需谨慎对待。
龙葵属于茄科植物，全株均含有龙葵碱，其中根茎部位的生物碱浓度相对较高。龙葵碱具有抑制胆碱酯酶活性的作用，过量摄入会导致口腔灼痛、恶心呕吐、腹痛腹泻等消化道症状，严重时可能伴随头痛、心率加快、呼吸困难等全身反应。新鲜根茎的毒性尤为明显，民间自行煎煮或泡制时若未能完全破坏毒素，仍存在中毒风险。
若因治疗需求需使用龙葵根茎，应在中医师指导下经过规范的炮制加工，通过蒸煮、晾晒等工艺降低毒性成分。日常应避免随意采挖野生龙葵根部食用，家长需注意防止儿童误食庭院中种植的龙葵根茎。若误食后出现舌头发麻、胃部不适等症状，应立即漱口并携带植株样本就医。