花蛤的胆固醇含量一般不高，每100克可食部分约含40-60毫克胆固醇，属于中等偏低水平。其胆固醇含量低于虾、蟹及动物内脏等食物，但略高于部分鱼类，适量食用通常不会对健康造成明显影响。
花蛤的胆固醇含量与常见高胆固醇食物相比具有优势。例如，鸡蛋的胆固醇含量约为373毫克/100克，而虾类普遍在150毫克以上。花蛤作为低脂高蛋白的贝类，还富含锌、硒等微量元素，有助于维持正常生理功能。对于健康人群，每日摄入量控制在100-150克范围内是较为适宜的。
需要控制胆固醇摄入的高血脂患者，可将花蛤作为优质蛋白来源替代部分红肉。但需注意烹饪方式，避免使用动物油煎炸，建议选择清蒸、煮汤等低脂做法。日常饮食中建议保持食物多样性，搭配蔬菜和全谷物共同食用，更有助于营养均衡。