蜂蜜水长期存放是否会变质一般需要根据保存条件等因素判断，不能一概而论。如果保存得当且存放时间较短，通常不会变质。如果保存不当或存放时间过长，则可能发生变质。
蜂蜜水含有一定糖分和水分，若处于密封状态并冷藏保存，通常可抑制微生物繁殖，短期内不会变质。若蜂蜜水处于常温环境或密封不严，可能导致细菌等微生物滋生，存放时间较长时可能出现酸败、异味等变质表现。此外，制作蜂蜜水时若容器不洁净或混入杂质，也可能加速变质进程。
建议将蜂蜜水密封后放入冰箱冷藏保存，并尽量在24小时内饮用完毕。如果发现蜂蜜水出现气泡、浑浊、异味等异常情况，应立即停止饮用。饮用后若出现腹痛、腹泻等不适症状，需及时就医处理。