半生不熟的贝类可能存在寄生虫感染风险，同时也可能携带细菌或病毒。是否含有寄生虫需根据贝类品种、生长水域及加工方式综合判断，无法一概而论。
贝类可能携带的病原体包括华支睾吸虫、异尖线虫等寄生虫，这些寄生虫的幼虫阶段常寄生在贝类体内。若烹饪温度未达到70摄氏度以上且持续时间不足，幼虫可能存活并随食物进入人体，引发腹痛、腹泻等症状。诺如病毒和副溶血性弧菌也常存在于未煮熟的贝类中，前者可通过污染水域进入贝类体内，后者在海洋环境中广泛存在，均可导致急性胃肠炎。
贝类品种差异影响寄生虫风险，牡蛎、贻贝等滤食性贝类接触寄生虫概率较高。生长水域的水质污染程度直接影响贝类携带病原体的可能性，近海养殖贝类风险通常高于深海品种。家庭厨房处理时若未将贝类彻底清洗，或生熟食器具交叉使用，可能造成二次污染。
建议将贝类彻底加热至外壳张开后继续烹煮3-5分钟，处理过程中使用专用刀具和砧板。购买时应选择外壳完整、来源清晰的品种，冷冻处理可在-20摄氏度条件下持续24小时以灭活部分寄生虫。若食用后出现持续腹痛、发热或血便等症状，应及时就诊进行寄生虫检测。