巴沙鱼冷冻后部分营养成分可能会流失，但整体营养价值仍较为稳定。冷冻保存是常见的食品保鲜方式，正确操作可以最大限度保留其营养。
巴沙鱼富含优质蛋白质、维生素B12以及磷、硒等矿物质。在冷冻过程中，细胞结构可能因冰晶形成而受损，导致部分水溶性维生素如维生素B12在解冻时随汁液流失。但蛋白质和矿物质性质稳定，通常不会因低温发生分解或破坏。若采用快速冷冻技术，并在-18℃以下恒温储存，可减少细胞破裂程度，降低营养损失。
建议选择正规厂家生产的冷冻巴沙鱼，避免反复冻融。解冻时采用冷藏室缓慢解冻法，而非流水冲洗或高温解冻，可减少汁液流失。若长期储存超过3个月，建议关注产品包装上的保质期标识。日常饮食中应注意搭配新鲜蔬菜补充可能流失的水溶性维生素。